Беата Чеховска-Деркач, пресс-секретарь Гданьского университета, объявила во вторник об успехе ученого.
«Полученные данные позволят ученым со всего мира учитывать Польшу в своих исследованиях, связанных с эпидемиологией заболевания COVID-19. Это важный вклад в понимание молекулярной эволюции вируса и может способствовать выбору вакцины и лекарства в будущем. Пока в GISAID, в крупнейшей базе данных, куда ученые со всего мира уже внесли более 5000 последовательностей, не было ни одного польского изолята, полученного непосредственно от пациента", - подчеркнула пресс-секретарь UG.
Доктор Лукаш Робальски — доцент кафедры рекомбинантных вакцин Межвузовского факультета биотехнологии Гданьского университета и Гданьского медицинского университета.
Генетическая последовательность содержит много важной информации, например, о том, как вирус «обманывает» организм человека, ослабляя его иммунитет.
«Выделив такую последовательность, то есть расшифровав вирус, можно лучше понять свойства вируса, включая его происхождение, как в эволюционном, так и в географическом контексте», — объяснила Чеховска-Деркач.
Генетический материал был выделен в Лаборатории молекулярно-биологической диагностики ООО, расположенной в 7-м Военно-морском госпитале в Гданьске. Это лаборатория, созданная благодаря пожертвованию Гданьского университета специализированного оборудования.
Для расшифровки вируса от польского пациента из Померании использовалось секвенатор последнего поколения от Oxford Nanopore Technologies, а это означает отсутствие дополнительных процедур, которые могли бы внести искажения. Протоколы биоинформатики, ранее разработанные учеными ARTIC, также использовались для сбора генетических данных во время эпидемии вируса Эбола в Африке.
«Генетический материал должен соответствовать множеству качественных и количественных стандартов, чтобы иметь возможность его расшифровать. В случае вирусов, генетический материал которых представляет собой одноцепочечную РНК, используются методы увеличения количества генетического материала. Традиционно до сих пор это было сделано путем дублирования вирусных частиц в лабораториях. «Теперь, благодаря достижениям в области молекулярной биологии, можно использовать более короткий путь без необходимости культивирования вируса», - пояснил доктор Робальски, цитируемый в пресс-релизе.
В настоящее время проводится дальнейшее секвенирование вирусов от польских пациентов, выделенных в гематологической лаборатории Университетского клинического центра в Гданьске, и в ближайшие дни планируется отправить дополнительные секвенирования.
Вирус SARS-CoV-2 также был выделен и охарактеризован другой командой, Малопольским центром биотехнологии Ягеллонского университета, в сотрудничестве с командой NIZP-PZH в Варшаве. Однако те исследования проводились более косвенным путем - вирус произошел от первого пациента из Польши, но был получен не напрямую от пациента, а из лабораторной культуры его клеток.
PAP - Наука в Польше, Роберт Петржак
роп/дки/
