Исследователи из Института Ненцки работают над процедурами групповых тестов на коронавирус

"27.04.2020"

Ученые из Института Ненцки Польской академии наук начали работу над протоколами, позволяющими проводить групповое тестирование при диагностике COVID-19. «Благодаря этому эффективность тестирования может увеличиться с 10 до 100 тысяч образцов в день», — подсчитали исследователи.

Ученые из Института Ненцки Польской академии наук начали работу над протоколами, позволяющими проводить групповое тестирование при диагностике COVID-19. «Благодаря этому эффективность тестирования может увеличиться с 10 до 100 тысяч образцов в день», —...
Fot. materiały prasowe Instytut Nenckiego PAN
Авторы проекта SONAR Anti-CoronaVirus предполагали, что можно будет одновременно тестировать целые группы людей, особо уязвимых к COVID-19, например, жителей домов социального престарелых или сотрудников больничных отделений. Коллектив под руководством проф. Агнешка Добжинь в ближайшие несколько недель разработает стратегию массового генетического тестирования, - сообщил Институт Ненцки Польской академии наук в Варшаве в заявлении, отправленном PAP. «По данным Санитарно-эпидемиологической станции, процент положительных тестов на SARS-CoV-2 составляет менее 5%. Это означает, что 95 процентов тесты, проведенные в Польше, являются отрицательными. Посредством группового тестирования мы могли бы легко отвергнуть людей, которые не являются носителями вируса, проведя несколько, а не несколько сотен тестов», — объясняет профессор. Агнешка Добжинь. Метод массового тестирования предполагает смешивание проб от нескольких десятков человек. Если результат теста положительный, генетический материал этих людей разделяют на две группы и каждую тестируют отдельно. Может оказаться, что одна из этих половин даст отрицательный результат, другая – положительный. Затем вся операция повторяется на гораздо меньшем количестве образцов и отлавливаются зараженные люди. В результате вместо десятков тестов, проведенных на всей группе, выполняется лишь несколько. «Групповое тестирование применяется и чрезвычайно эффективно при выявлении различных вирусных заболеваний, в том числе: ВИЧ, ВГВ, ВГС или вирус гриппа», — поясняется в объявлении. Институт Ненцки сообщает, что за последние недели центры в Израиле, Индии, Германии и США исследовали и подтвердили полезность группового тестирования в диагностике SARS-CoV-2. Вот почему в этих странах людям ставят такой диагноз, даже если они бессимптомны. В середине апреля Индийский совет медицинских исследований рекомендовал диагностическим центрам Индии использовать групповые тесты, и они были реализованы во многих штатах, в том числе: в штате Уттар-Прадеш. «Групповое тестирование до сих пор не использовалось в Польше, потому что не было диагностического протокола, который позволял бы проводить его эффективно. И в этом задача команды Института Ненцки Польской академии наук: создать процедуры, которые будут гарантировать надежные результаты», — пишут представители Ненцки. В рамках проекта SONAR Anti-CoronaVirus ученые определят оптимальный размер группы, тестируемой за один раз, и насколько можно разбавить собранный материал — чтобы вирус все еще можно было обнаружить. На этом этапе будет использоваться материал, полученный от Санитарно-эпидемиологической станции, это будут реальные, положительно проверенные образцы. «У нас есть сообщения, что в других странах одновременно тестируется до нескольких десятков образцов. Стандарт — 32, но в наших исследованиях мы планируем проверить возможность объединения образцов до 64. Конечно, теоретически, чем больше группа, тем лучше, потому что для постановки диагноза и получения результата необходимо провести меньше тестов. Однако существует опасность, что если в этой большой группе будет один положительный тест, а концентрация вируса очень низкая, его может не быть. Поэтому крайне важно найти тест, достаточно чувствительный, чтобы обнаружить присутствие вируса на низком уровне», — описывает профессор Добжинь. Отсюда следующий этап проекта SONAR Anti-CoronaVirus, в рамках которого ученые проверят все доступные на рынке генетические тесты на наличие SARS-CoV-2. В том числе новейшее изобретение ученых Института биоорганической химии Польской академии наук в Познани. Идея состоит в том, чтобы найти тот, который даст наименьший процент ложноотрицательных результатов. Наконец, в сотрудничестве со специалистами Института компьютерных наук факультета компьютерных наук, математики и механики Варшавского университета будет создано специальное программное обеспечение, которое будет указывать диагностам, какие образцы они могут объединить в одну тестовую группу. Идея состоит в том, чтобы выбрать группу пациентов, которые имеют одинаковую вероятность заражения. Это сделает результаты более достоверными. «Это могут быть воспитанники социальных домов, работники одного больничного отделения – врачи, медсестры. Тест можно было бы проводить каждый день, чтобы люди могли чувствовать себя комфортно на работе и знать, что все, кого они встречают, здоровы, а во-вторых, чтобы как можно быстрее обнаружить инфекцию, если она произойдет в этой группе", - говорит профессор. Добжинь. Самое главное, что разработанные таким образом процедуры группового тестирования могут быть запущены на уже существующих в Польше диагностических учреждениях. «При том же количестве тестов, устройств qPCR и диагностических лабораторий, уполномоченных выполнять этот тип анализа, мы могли бы достичь масштаба до ста тысяч тестов в день. Под тестом я имею в виду протестированный образец», — добавляет профессор. Добжинь. По текущим прогнозам, вирус SARS-CoV-2 останется с нами надолго, возможно, на годы. «Стратегия группового тестирования будет полезна на каждом этапе развития эпидемии», — подчеркивает профессор. Добжинь. Многие люди переносят COVID-19 бессимптомно и не подозревают, что он заразен. Проект SONAR Anti-CoronaVirus реализуется при поддержке Министерства науки и высшего образования (PAP) лт/агт/